Con caràcter anual, el Consell elaborarà i la Presidència de la institució aprovarà un avantprojecte de pressupost, amb l'estructura que assenyali el Ministeri d'Hisenda, i el remetrà a aquest per a la seva posterior integració en els Pressupostos Generals de l'Estat, d'acord amb el que es preveu en la Llei 47/2003, de 26 de novembre.
El pressupost tindrà caràcter limitatiu pel seu import global i caràcter estimatiu per a la distribució dels crèdits per categories econòmiques, amb excepció dels corresponents a despeses de personal i de les subvencions nominatives i les atencions protocol·làries i representatives, que tindran caràcter limitatiu i vinculant.
A la Presidència del Consell li correspon autoritzar les variacions pressupostàries que impliquin fins a un 3% de la xifra inicial del seu pressupost total de despeses, sempre que no s'incrementin els crèdits per a despeses de personal. Las variacions per sobre d'aquest percentatge hauran de ser autoritzades per la persona titular del Ministeri d'Hisenda.
Les variacions internes entre les diverses partides pressupostàries que no incrementi la quantia global del pressupost, seran adoptades per la Presidència del Consell, tret que afectin dels crèdits per a despeses de personal, que hauran de ser autoritzades per la persona titular del Ministeri d'Hisenda.
