Na designación da persoa que ocupa a Presidencia do Consello interveñen o Goberno e o Congreso dos Deputados. O Goberno propón un candidato ou candidata, que deberá ser unha persoa de recoñecido prestixio e competencia profesional. A persoa proposta deberá comparecer na Comisión correspondente do Congreso dos Deputados e obter o referendo da Cámara por maioría absoluta. Finalmente, o nomeamento realízase por Real Decreto aprobado en Consello de Ministros.

A Presidencia, cuxo mandato é de cinco anos, non renovable, exerce as súas funcións con plena independencia e total obxectividade, non está suxeita a mandato imperativo e non recibe instrución de autoridade algunha. Exerce as súas funcións con dedicación exclusiva e plena suxeición ao réxime de incompatibilidades dos altos cargos da Administración Xeral do Estado.

A Lei 19/2013 de transparencia, acceso á información pública e bo goberno atribúe á Presidencia do Consello amplas responsabilidades na gobernación da institución e na toma de decisións. As súas funcións están reguladas no artigo 38 desta norma e no artigo 13 do Estatuto do Consello.

Ostenta a representación legal e institucional do Consello e dirixe e coordina as actividades de todos os seus órganos directivos. Coñece das reclamacións de amparo sobre acceso á información pública, adopta criterios de interpretación uniforme das obrigas da Lei de transparencia e directrices, recomendacións ou guías para a súa correcta aplicación, e responde as consultas que formulan os órganos encargados de tramitar e resolver as solicitudes de acceso á información, entre outras funcións.

Ademais, celebra contratos e convenios, autoriza gastos e pagos, formula e aproba as contas anuais da entidade e exerce as funcións de xefatura do persoal. Tamén participa con frecuencia en distintos foros, simposios, encontros e conferencias, tanto nacionais como internacionais. E comparece, polo menos unha vez ao ano, no Congreso para informar e render contas sobre a actividade da institución e presentar a memoria anual do Consello.

Fco. Javier Amorós Dorda (presidente en funcións. Novembro de 2017-outubro de 2020)

Licenciado en Derecho por la Universidad Complutense de Madrid y funcionario del Cuerpo Superior de Administradores Civiles del Estado desde 1982. Ha desempeñado diversos puestos en la Administración General del Estado, entre ellos, los de subdirector general de Clases Pasivas en el Ministerio de Hacienda y subdirector general de Organización y Procedimientos en el Ministerio de Hacienda y Administraciones Públicas. En diciembre de 2014 fue nombrado subdirector general de Transparencia y Buen Gobierno del Consejo de Transparencia y Buen Gobierno. Tras el fallecimiento de Esther Arizmendi ejerció la Presidencia interina de la institución hasta el nombramiento de José Luis Rodríguez Álvarez en octubre de 2020.

Esther Arizmendi Gutiérrez (decembro de 2014-novembro de 2017)

Licenciada en Dereito pola Universidade Complutense de Madrid e técnico superior de Administración Xeral, Administración Local e Administración Civil do Estado. Desenvolveu unha longa traxectoria de máis de tres décadas na administración, onde, entre outras responsabilidades, foi director xeneral de Modernización Administrativa, Procedementos e Impulso da Administración Electrónica. Foi relator da Comisión para a Reforma das Administracións Públicas (CORA) como presidenta da Subcomisión de Simplificación Administrativa antes de que se crease o Consello de Transparencia e Bo Goberno, para cuxa Presidencia foi nomeada en decembro de 2014. Puxo en marcha a institución, e estivo á fronte do Consello ata o seu falecemento, en novembro de 2017.